El Programa de Acciones Estratégicas ha sido diseñado para ser implementado a través de un portafolio de proyectos correspondiente a las Acciones Estratégicas que abordan los problemas transfronterizos prioritarios identificados en el Análisis de Diagnóstico Transfronterizo (ADT) Regional. Para facilitar el proceso de implementación del PAE y el establecimiento conjunto de protocolos, reglamentos y actividades regionales, las Acciones Estratégicas se han agrupado en seis áreas temáticas, considerando la sinergia entre ellas:
Los primeros proyectos se están implementando a través de Puntos Focales Nacionales designados por los Países Miembros y con la participación de múltiples actores a nivel local, nacional y regional.
La participación ciudadana en la toma de decisiones es fundamental en la ejecución de los proyectos, ya que, según la evidencia acumulada, puede mejorar la calidad y la aceptación de las decisiones resultantes, y es una herramienta para la reducción de la pobreza. Por esta razón, cada proyecto en ejecución pone en práctica un proceso de movilización y participación ciudadana informada de los actores sociales colectivos de la cuenca, asegurando la apropiación del PAE y proporcionando un mecanismo duradero y sostenible para la implementación de la Gestión Integrada de los Recursos Hídricos (GIRH) en la región.